Los ciudadanos de la Unión Europea que residan en las islas Baleares, islas Canarias, Ceuta o Melilla pueden beneficiarse de un descuento del 75% de la tarifa del pasajero o del 89% en el caso de los residentes en Formentera.
No obstante, puede que no siempre se vea reflejado el descuento exacto en el precio final. Esto puede ser debido a que la bonificación solo se aplica al pasajero, no a los servicios adicionales que contrate. De esta manera, la parte del billete correspondiente al vehículo no es bonificable (a no ser que se disponga de una tarjeta de estacionamiento autorizado, TEA) como tampoco lo es el pasaje de las mascotas, la contratación de servicios adicionales como internet o menús abordo o el transporte de mercancías especiales.
Por el contrario, si es bonificable el coste del pasaje en diferentes acomodaciones*, como butaca, butaca superior, salón VIP o camarote en función de las acomodaciones que ofrezca la ruta en cuestión.
*La acomodación Camarote Exterior no es bonificable en las rutas con origen o destino Melilla.